Efectivamente gaikoku se refiere a algo ajeno a Japón. De ultramar, extranjero.
Cuando se refiere a una persona se usa la contracción gaijin.
El uso de gaikoku como prefijo es para resaltar el hecho de que no son obras estrictamente apegadas a las reglas japonesas.
No existe ninguna línea sobre el empleo del prefijo, así que lo uso por elección personal.